Mit der Universität verbundene Einrichtungen

• Max-Planck-Institut für terrestrische Mikrobiologie
  Seit 1991 arbeitet das MPI über mikrobiologische Ökologie mit dem Schwerpunkt auf Biogeochemie, Biochemie, Ökophysiologie und organischen Interaktionen.
   
• Herder-Institut (Institut der Leibniz-Gemeinschaft)
  Seit seiner Gründung 1950 ist es eine der zentralen Institutionen der historischen Ostmitteleuropa-Forschung in Deutschland. Als eine von Bund und Bundesländern finanzierte außeruniversitäre Einrichtung erfüllt es die Funktion einer Forschungsstätte und wissenschaftlichen Serviceeinrichtung.
   
• Hessisches Landesamt für geschichtliche Landeskunde
  Die Einrichtung im Geschäftsbereich des Hessischen Ministeriums für Wissenschaft und Kunst, die 1920 zunächst außerhalb der öffentlichen Verwaltung entstand, hat die Aufgabe, die geschichtliche Landeskunde wissenschaftlich zu fördern und Grundlagenforschung zu betreiben.
   
• Hessisches Staatsarchiv Marburg
   
• Archivschule Marburg
  Die zentrale Aus- und Fortbildungseinrichtung des Archivwesens der Bundesrepublik Deutschland bildet seit mehr als 50 Jahren Archivarinnen und Archivare des höheren, wie auch des gehobenen Archivdienstes aus.
   
• Deutsche Blindenstudienanstalt e.V.
  Seit ihrer Gründung 1916 hat sich die Blista aus kleinen Anfängen zum Zentrum der höheren Bildung für Blinde und Sehbehinderte in der Bundesrepublik Deutschland und darüber hinaus entwickelt.
   
• Deutsches Spiele-Archiv
  Das Deutsche Spiele-Archiv hat sich die Aufgabe gestellt, die Spiele-Produktion nach 1945 bis heute zu dokumentieren und damit Grundlagen für eine intensive Analyse und wissenschaftliche Reflexion der Spiel-Entwicklung unserer Zeit zu schaffen.

• Corpus der minoischen Siegel
  Die Arbeitsstelle sammelt und editiert alle minoischen und helladischen Siegel. Ihr Archiv umfasst Fotos der Originale und Abdrücke sowie der Motivzeichnungen und ein nahezu vollständiges Abdruckarchiv.