Vorlesung Biochemie I + II

am Fachbereich Chemie

(3-stündig, 2-semestrig)
(Prof. Marahiel, Prof. Essen)
Di. und Do. 10:15, Fr. 8:15, HS E

Methoden-Seminar

am Fachbereich Chemie

(2-stündig)
(Prof. Marahiel, Prof. Essen, Dr. Linne)
Mi 8:15, HS E

Sommersemester
Biochemie I

1.	Proteine: Aufbau und Struktur Peptidbindung, alpha-Helix, beta-Faltblatt (Powerpoint-Datei = 7.1 MB) (Powerpoint-Datei = 23.5 MB) (Powerpoint-Datei = 5.6 MB)	ES
2.	Struktur von Proteinen: Faserproteine, Hämoglobin, Myoglobin (Powerpoint-Datei = 16.5 MB) (Powerpoint-Datei = 19.8 MB) Proteinfaltung (Powerpoint-Datei = 8 MB)	ES
3.	Enzymkinetik Michaelis-Menten-Theorie, Hemmungstypen, Wechselzahl, allosterische Interaktion (Powerpoint-Datei = 8.1 MB) (Powerpoint-Datei = 2.7 MB) (Powerpoint-Datei = 8.1 MB)	ES

4.	Enzymmechanismen (ohne Coenzyme) Beispiel Proteasen, Lysozym, Aldol-Reaktionen (Powerpoint-Datei = 18.8 MB) (Powerpoint-Datei = 5.3 MB)	ES
5.	Coenzyme und Beispiele zum Mechanismus Pyridinnukleotide, Flavine, ATP, Tetrahydrofolsäure, Pyridoxalphosphat, Thiamindiphosphat und Ketol-Reaktionen, Coenzym-A, Isomerisierungen, aktivierte (Powerpoint-Datei = 3.8 MB) (Powerpoint-Datei = 8.2 MB) (Powerpoint-Datei = 2.6 MB) Zucker, Proteine modifiziert mit Lipid- oder Glykostrukturen (Powerpoint-Datei = 7.3 MB) (Powerpoint-Datei = 13 MB) (Powerpoint-Datei = 9.4 MB) (Powerpoint-Datei = 10.8 MB)	ES

6.	Das Erbmaterial: DNA; Basen, Nukleotide, Doppelhelix, Chromatin; Nukleosomen, Histone, Zellzyklus, DNA-umsetzende Enzyme Endonukleasen, Ligase, Topoisomerase (Powerpoint-Datei)	MA
7.	DNA-Replikation, DNA-Reparatur Komponenten des Replikationsapparates (Powerpoint-Datei)	MA
8.	Transkription bei Prokaryonten RNA-Polymerase, Operonmodell Transkription bei Eukaryonten RNA-Polymerasen, cis-agierende Elemente, Transkriptionsfaktoren, Motive (Powerpoint-Datei)	MA

9.	Translation bei Prokaryonten Initiation, Elongation, Termination, Faktoren	MA
10.	Exkurs: Nicht-ribosomale Peptidsynthese (Powerpoint-Datei)	UL
11.	Post-transkriptionale Modifikationen cap und Polyadenylierung, Spleißen, Zusammensetzung der Spleißosomen	MA
12.	Mitochondrien und Plastide: Genom, Transkription, Translation	MA
13.	Protein-Biosynthese in Eukaryonten	MA
14.	Chemische Modifikationen (co- und posttranslational); Präpro-Insulin, Signalerkennungspartikel, G-Protein	MA
15.	Spezielle Beispiele der Transkriptionskontrolle, lambda-Phage (Powerpoint-Datei = 4 MB)	MA
16.	Viren, Transformation und Onkogene, Transgene Organismen	ES

Wintersemester
Biochemie II

1.	Übersicht über den Stoffwechsel bc2_01_metabolism-MM.pdf	MA
2.	Glykolyse bc2_02_glycolyse1-MM.pdf Enzymmechanismen (GAPDH, Aldolase), Regulation (PFK-1, PFK-2) bc2_03_glycolyse2-MM.ppt	MA
3.	Zucker, Polysaccharide bc2_04_side_reactions-MM.pdf Glykogen, Biosynthese, Abbau, Regulation; Übersicht über den Pentosephosphat-Weg; Gluconeogenese	MA
4.	Citratzyklus download Pyruvat-Dehydrogenase-Komplex Anaplerotische Reaktionen; Shuttle-Systeme (NADH, AcCoA, NADPH)	MA

5.	Abbau von Lipiden (Powerpoint-Datei = 14 MB) (Powerpoint-Datei = 18 MB) Fettsäuren, beta-Oxidation in Mitochondrien, Peroxisomen; Ketonkörper (Powerpoint-Datei = 12 MB)	ES
6.	Biosynthese von Lipiden (Powerpoint-Datei = 5 MB) (Powerpoint-Datei = 4 MB) Powerpoint-Datei = 11 MB) Phospholipide, Ceramide, Ganglioside; Lipoxygenasen, Prostaglandine, Leukotriene; Cholesterinester, Lipidtransport im Blut	ES
7.	Elektronentransportketten Strukturen der prosthetischen Gruppen Mitochondriale Elektronentransportketten, Enzymkomplexe, Membranpotential, ATP-Synthasen download	MA
8.	Elektronentransportketten und Photosynthese; Übersicht über Photoassimilation; Regulation des Stärke-Stoffwechselsbc2_photosyn.pdf	MA
9.	Isoprenoide, Steroidhormone und Gen-Aktivierung; Porphyrine	MA
10.	Abbau von Aminosäuren; von Aminosäuren ausgehende Biosynthesen Transaminierung, Aminosäureabbau, Harnstoffzyklus download	ES
11.	NH₃-Assimilierung, Biosynthese von Aminosäuren (Powerpoint-Datei = 3.2 MB) (Powerpoint-Datei = 7.7 MB) Biosynthese von Purinen, Pyrimidinen und Nukleotiden (Powerpoint-Datei = 12.8 MB) (Powerpoint-Datei = 3.6 MB)	ES

12.	Signaltransduktion; Hormone, Rezeptoren, Signalketten download	ES
13.	Immunologie Antikörperstruktur, B-Zellen, T-Zellantigene Immunglobulin-Gene	MA
14.	Zytoskelett, Kontraktile Systeme (Powerpoint-Datei = 10 MB) Actin, Myosin, Tubulin, Dynein/Kinesin (Powerpoint-Datei = 2.3 MB)	ES
15.	Biochemie des Nervensystems Aktionspotential, Acetylcholinrezeptor (Powerpoint-Datei = 15.7 MB) (Powerpoint-Datei = 4.5 MB)	ES
16.	Gerinnungskaskade (Powerpoint-Datei = 8.8 MB)	ES

Methoden-Seminar

1.	Einführung in die Proteinreinigung (T. Knappe) Proteinreinigung_Knappe.pdf
2.	Flüssigkeitschromatographie (S. Reitz) Flüssigkeitschromatographie.pdf
3.	Affinitätschromatographie (S. Samel) Affinitätschromatographie.pdf
4.	Gelelektrophorese (S. Samel) Gelelektrophorese.pdf
5.	Einführung in die Proteinkristallographie
6.	Einführung in die Molekularbiologie I (G. Schönafinger) MolBioI.ppt
7.	Einführung in die Molekularbiologie II (M. Wittmann) MolBioII.pdf
8.	Peptidsynthetasen, DNA-Sequenzierung (M. Miethke) NRPS.ppt
9.	Rekombinante Produktion von Proteinen: Expressionssysteme, His-Tag-Affinitätsreinigung von Fusionsproteinen, Verfahrensweise zur Expressionsoptimierung (D. Kress) Proteinexpression.pdf
10.	HPLC/MS Analyse von Naturstoffen und Proteinen (U. Linne) Funktionsweise Ion Trap.exe FTICR.exe Bioanalytik.pdf
S1	UV-VIS-Spektroskopie (Zhen Li) UV-VIS.pdf
S2	2D-Gelelektrophorese, nanoHPLC, MDLC (Eduard Oplesch) Chromatographie.pdf
S3	Klassische biochemische Methoden der Proteinsequenzierung (Manuel Streib) Poteomics I.pdf
S4	Quantitative Proteomanalyse (Crispin Lichtenberg) Proteomics II.pdf
S5	Atomic Force Microscopy (Helene Unger) AFM.pdf
S6	Green Fluorescent Protein - Mechanismus und Anwendungen (Christopher Grosche) Gfp.pdf
S7	Oberflächenplasmonresonanz (Gunther Zimmermann) BIACORE.pdf
S8	Quantum Dots (Volker Gatterdam) Quantum_Dots.pdf