Software & Datenbanken

SCUBIDOO & PINGUI

Die Datenbank "Screenable Chemical Universe Based on Intuitive Data OrganizatiOn" (J. Chem. Inf. Model. 2015, 55, 1824-1835, [pdf]) ist hier zu finden.
PINGUI (J. Med. Chem. 2018, 61, 1118-1129, [pdf]) steht für die automatisierte Dervatisierung von bekannten (fragmentgroßen) Liganden hier zur Verfügung.
PrenDB

Unsere Datenbank in der Reaktionen der Prenyltransferasen katalogisiert sind und mit der sich Prenylierungsstellen vorhersagen lassen (J. Biol. Chem. 2017, 292, 4003-4021, [pdf]) ist unter diesem Link zu finden.
DAIM - ein Programm zur Erzeugung von Molekülfragmenten

Wir entwickeln und betreuen DAIM (Decomposition And Identification of Molecules), ein Programm zur Generierung von Molekülfragmenten im Kontext von fragment-basiertem Docking und der Analyse von Moleküldatenbanken. Für weitere Informationen und potentielle andere Anwendungen von DAIM lesen Sie bitte die Bedienungsanleitung oder Publikation [4]. Wir sind auch immer froh über Fehlermeldungen, wollen jedoch anregen vorher diese Anleitung von Simon Tatham zu lesen.
Am 7. September 2009 wurde DAIM 5.3 veröffentlicht. Diese Aktualisierung enthält einige Verbesserungen und unterstützt mehr anwenderspezifische Einstellungen in Bezug auf die zu schneidenden Bindungen. Kurz gesagt ist es nun möglich, alle Grundeinstellungen zu umgehen. Das Programm kann auf dieser Seite heruntergeladen werden.